More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1701 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
445 aa  908    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  69.37 
 
 
446 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  72.13 
 
 
446 aa  664    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  71.62 
 
 
446 aa  629  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  64.72 
 
 
447 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  61.54 
 
 
448 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  60.18 
 
 
446 aa  559  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  63.37 
 
 
445 aa  555  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
448 aa  442  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
449 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
449 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 
449 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  43.31 
 
 
446 aa  362  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  38.19 
 
 
430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  38.44 
 
 
457 aa  319  7e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  40.33 
 
 
431 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  37.39 
 
 
453 aa  316  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  39.08 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  35.4 
 
 
431 aa  312  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  35.4 
 
 
431 aa  312  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  38.22 
 
 
434 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  35 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  39.05 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  39.05 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  38.14 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  37.76 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  37.86 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  38.62 
 
 
458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  37.23 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  38.39 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  38.57 
 
 
430 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  36.7 
 
 
431 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  39.81 
 
 
435 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  36.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  36.53 
 
 
435 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 
435 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  36.53 
 
 
435 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  37.65 
 
 
431 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  38.65 
 
 
422 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  36.47 
 
 
431 aa  299  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
451 aa  299  6e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  37.38 
 
 
430 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
451 aa  298  9e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  39.79 
 
 
430 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
451 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  36.3 
 
 
435 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  40.89 
 
 
431 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  38.62 
 
 
432 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  38.32 
 
 
431 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
430 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  37.14 
 
 
431 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
431 aa  295  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  37.16 
 
 
431 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  39.01 
 
 
431 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  35.62 
 
 
433 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  40.05 
 
 
431 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
431 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  36.01 
 
 
431 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
438 aa  289  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  35.98 
 
 
425 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  37.18 
 
 
437 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  39.57 
 
 
431 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  35.81 
 
 
436 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  38.06 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  39.75 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 
432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  34.98 
 
 
454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  40.47 
 
 
431 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  34.61 
 
 
433 aa  282  7.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  37.76 
 
 
437 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  34.61 
 
 
432 aa  282  9e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  37.16 
 
 
431 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  36.92 
 
 
431 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  35.82 
 
 
431 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  39.66 
 
 
434 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  39.66 
 
 
434 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  40.05 
 
 
431 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 
436 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  38.05 
 
 
431 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  35.55 
 
 
431 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  34.64 
 
 
430 aa  279  9e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  35.59 
 
 
443 aa  279  9e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  39.69 
 
 
431 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  39.81 
 
 
435 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  38.12 
 
 
433 aa  278  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  35.15 
 
 
433 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  38.93 
 
 
434 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  38.48 
 
 
425 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 
433 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>