More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0216 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  97.33 
 
 
449 aa  904    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  92.2 
 
 
449 aa  830    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
449 aa  924    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  80.31 
 
 
448 aa  769    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  97.77 
 
 
449 aa  882    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  56.26 
 
 
448 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  55.43 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  54.2 
 
 
445 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  51.93 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
445 aa  441  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  46.34 
 
 
431 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  44.55 
 
 
430 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  44.95 
 
 
430 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 
430 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  43.87 
 
 
438 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  43.26 
 
 
431 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  42.55 
 
 
433 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  42.83 
 
 
446 aa  347  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  42.03 
 
 
431 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  38.69 
 
 
453 aa  345  6e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  42.32 
 
 
430 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  41.23 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  39.46 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  41.39 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  41.61 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  41.47 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  39 
 
 
451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  39.81 
 
 
432 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  41.23 
 
 
435 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  38.78 
 
 
451 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  39.24 
 
 
431 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  41 
 
 
435 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  41 
 
 
435 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  41.23 
 
 
431 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
431 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  332  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  39.33 
 
 
457 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  40.77 
 
 
435 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  41.57 
 
 
431 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  40.55 
 
 
433 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  38.3 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  39.62 
 
 
431 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  39.71 
 
 
431 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  39.26 
 
 
431 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  323  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  37.93 
 
 
430 aa  323  4e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  39.68 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  39.23 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
458 aa  317  3e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  39.08 
 
 
433 aa  317  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
431 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  39.68 
 
 
431 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  39.95 
 
 
434 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  39.21 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  40.23 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  38.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  37.82 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  39.48 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  37.82 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 
454 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  38.34 
 
 
432 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  34.86 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  38.11 
 
 
432 aa  310  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  38.36 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  39.13 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  38.36 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  38.72 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  37.76 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  38.53 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  38.67 
 
 
435 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  39.47 
 
 
433 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  39.95 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  38.85 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  37.74 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  34.63 
 
 
433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  37.32 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  38.06 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  39 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  36.56 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  37.5 
 
 
425 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  37.91 
 
 
450 aa  302  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
431 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  38.07 
 
 
434 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  38.44 
 
 
452 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  38.9 
 
 
435 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  37.73 
 
 
431 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  39.47 
 
 
433 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  38.28 
 
 
431 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>