More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0781 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
446 aa  910    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  69.59 
 
 
446 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  72.13 
 
 
445 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  67.42 
 
 
447 aa  625  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  70.63 
 
 
446 aa  626  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  63.35 
 
 
448 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  61.35 
 
 
445 aa  535  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 
449 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 
448 aa  448  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 
449 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 
449 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  43.68 
 
 
446 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  39.63 
 
 
457 aa  339  7e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
431 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  37.84 
 
 
453 aa  315  8e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  35.71 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  39.34 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  39.14 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  38.01 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 
431 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  35.65 
 
 
431 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  40.19 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  36.72 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  41.84 
 
 
435 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  36.72 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  36.03 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 
435 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 
435 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  36.78 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  37.95 
 
 
431 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  36.32 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  38.41 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  37.23 
 
 
451 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  36.55 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  38.66 
 
 
433 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  37.92 
 
 
431 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
431 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
451 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
435 aa  299  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  38.66 
 
 
430 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 
431 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  35.57 
 
 
430 aa  295  8e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  35.81 
 
 
431 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  35.81 
 
 
431 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
430 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  37 
 
 
454 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  37.88 
 
 
437 aa  292  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  35.87 
 
 
454 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
431 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  37.38 
 
 
443 aa  290  4e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  37.95 
 
 
431 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  35.1 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  34.87 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  37.81 
 
 
454 aa  289  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  37.62 
 
 
430 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
430 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  38.29 
 
 
431 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  37.36 
 
 
454 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  37.71 
 
 
431 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  36.05 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  38.72 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  35.85 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 
431 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  37.38 
 
 
431 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  38.89 
 
 
432 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  35.66 
 
 
431 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  37.84 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  37.84 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  35.33 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  37.71 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 
432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  41.33 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  39 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  38.08 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
431 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  37.16 
 
 
434 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  34.64 
 
 
431 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  36.08 
 
 
431 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 
435 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  36.96 
 
 
422 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  34.87 
 
 
431 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  36.19 
 
 
431 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  35.31 
 
 
431 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  36.09 
 
 
435 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  34.91 
 
 
443 aa  278  9e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 
433 aa  278  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  36.93 
 
 
431 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>