More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1160 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  76.98 
 
 
448 aa  726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
446 aa  917    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  62.67 
 
 
446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  61.26 
 
 
446 aa  566  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  61.09 
 
 
447 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  60.18 
 
 
445 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  60.95 
 
 
445 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  61.85 
 
 
446 aa  537  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  54.98 
 
 
449 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  55.43 
 
 
449 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  54.98 
 
 
449 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  51.35 
 
 
448 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  54.3 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  43.72 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  41.01 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  39.63 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  39.64 
 
 
457 aa  334  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  39.46 
 
 
453 aa  335  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  41.43 
 
 
430 aa  332  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  41.43 
 
 
430 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  41.45 
 
 
431 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  40.9 
 
 
438 aa  328  9e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  38.34 
 
 
431 aa  327  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  39.29 
 
 
430 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  40.33 
 
 
434 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  38.95 
 
 
431 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  40.38 
 
 
431 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  39.05 
 
 
451 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  41.9 
 
 
431 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  38.72 
 
 
431 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  38.72 
 
 
431 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  38.37 
 
 
431 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  38.25 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  39.67 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  38.57 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  38.25 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  38.57 
 
 
451 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  40 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  38.88 
 
 
458 aa  319  6e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  39.38 
 
 
430 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  38.81 
 
 
431 aa  316  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  38.24 
 
 
433 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  38.25 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  39.18 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  38.94 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  38.94 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  38.8 
 
 
422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  38.7 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  38.46 
 
 
435 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  38.46 
 
 
435 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  38.37 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  39.62 
 
 
432 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  37.62 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  38.81 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  38.8 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  38.57 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  39.91 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  40.48 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  38.1 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  37.14 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  37.14 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  37.86 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  39.09 
 
 
431 aa  302  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  39.52 
 
 
431 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  38.72 
 
 
431 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  37.14 
 
 
430 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
432 aa  300  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  37.59 
 
 
443 aa  299  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
434 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  39.05 
 
 
431 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  35.7 
 
 
431 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
434 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  35.94 
 
 
432 aa  296  6e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  36.3 
 
 
425 aa  296  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
434 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  38.85 
 
 
437 aa  295  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  37.7 
 
 
438 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  37.86 
 
 
431 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  36.89 
 
 
431 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  37.35 
 
 
431 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  37.83 
 
 
426 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  37.14 
 
 
432 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  37.62 
 
 
435 aa  292  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  38.05 
 
 
443 aa  292  7e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  38.33 
 
 
435 aa  292  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 
434 aa  292  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  36.9 
 
 
431 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  38.13 
 
 
434 aa  291  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  37.1 
 
 
435 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  34.61 
 
 
433 aa  291  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  37.1 
 
 
435 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  36.67 
 
 
431 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  36.52 
 
 
430 aa  290  4e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>