More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0580 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  71.33 
 
 		 476 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  71.01 
 
 		 476 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  72.27 
 
 		 475 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  956    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  68.35 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  68.13 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  68.3 
 
 		 481 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  65.61 
 
 		 474 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  65.97 
 
 		 491 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  65.75 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  65.96 
 
 		 477 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  65.96 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  64.89 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  63.83 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  65.11 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  66.45 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  62.71 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  65.19 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  62.24 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  54.04 
 
 		 483 aa  495  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  54.14 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.77 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  31.32 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  34.42 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.72 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.51 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  32.08 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.55 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.75 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 477 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  33.7 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  31.29 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  29.85 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.13 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  33.42 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  31.69 
 
 		 431 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  32.57 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  30.52 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 		 431 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  29.45 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.54 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.23 
 
 		 450 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  31.04 
 
 		 431 aa  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  32.25 
 
 		 431 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  29.21 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  30.05 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  28.46 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  27.82 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  29.26 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.53 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  31.49 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  30.96 
 
 		 431 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  29.1 
 
 		 432 aa  150  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  28.24 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.71 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  29.76 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  30.31 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  27.52 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  32.14 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  30.08 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.38 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.55 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  30.27 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  30.48 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  30.6 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  26.22 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  27.48 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  28.89 
 
 		 431 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  28.89 
 
 		 431 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.44 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  30.23 
 
 		 435 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  30 
 
 		 435 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>