More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84718 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  64.69 
 
 		 489 aa  654    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  72.65 
 
 		 479 aa  739    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 483 aa  1004    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  55.77 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  58.59 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  55.8 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  58.59 
 
 		 476 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  56.58 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  56.7 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  55.82 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  53.09 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  51.81 
 
 		 476 aa  475  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  34.73 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  35.03 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  34.73 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  34.73 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  35.06 
 
 		 474 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  34.36 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  33.85 
 
 		 491 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  33.97 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  33.04 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  34.53 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  32.96 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  33.71 
 
 		 476 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  32.97 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  33.55 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  35.14 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  33.77 
 
 		 496 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  32.35 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  35.53 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  33.11 
 
 		 476 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  32.89 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  30.57 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  29.53 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.94 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  29.32 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  31.07 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  30.49 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.31 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  29.36 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  29.83 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  29.33 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  29.33 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  30.04 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  27.44 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  30.23 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  29.36 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  29.06 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  27.07 
 
 		 448 aa  167  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  29.77 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  28.99 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.74 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.74 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  28.47 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  32.12 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  28.83 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  28.31 
 
 		 431 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  28.94 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  28.26 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  27.69 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  28.33 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  27.56 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  28.07 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  29.23 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  30.77 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  28.72 
 
 		 431 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  28.72 
 
 		 431 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  29.48 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  30.69 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  28.46 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  29.37 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  27.8 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 431 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  28.95 
 
 		 446 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  27.96 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  28.6 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  28.84 
 
 		 422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  28.46 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  26.57 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  27.31 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  28.33 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>