More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6408 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  73.73 
 
 
476 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  73.25 
 
 
472 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  74.52 
 
 
481 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  72.82 
 
 
475 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  75.32 
 
 
475 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  76.86 
 
 
474 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  70.97 
 
 
496 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
472 aa  937    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  73.68 
 
 
476 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  70.91 
 
 
475 aa  640    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 
477 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  76.03 
 
 
474 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  74.1 
 
 
476 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  71.4 
 
 
479 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 
475 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  75.37 
 
 
491 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  74.1 
 
 
476 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  70.74 
 
 
476 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  66.45 
 
 
476 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  68.58 
 
 
475 aa  611  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.42 
 
 
474 aa  521  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 
483 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 
499 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 
475 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  32.4 
 
 
476 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  32.4 
 
 
476 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  33.63 
 
 
476 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  33.98 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  35.73 
 
 
483 aa  252  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  33.84 
 
 
475 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  35.35 
 
 
479 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  32.47 
 
 
473 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.37 
 
 
479 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  31.61 
 
 
476 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  32.89 
 
 
477 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  31.49 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  31.51 
 
 
435 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  29.56 
 
 
442 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  31.83 
 
 
435 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  32.24 
 
 
435 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.38 
 
 
435 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  29.56 
 
 
442 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  28.38 
 
 
432 aa  159  9e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  28.87 
 
 
447 aa  158  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  30.53 
 
 
447 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  29.33 
 
 
442 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  29.64 
 
 
442 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  30.91 
 
 
435 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  30.18 
 
 
447 aa  156  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  32.51 
 
 
435 aa  156  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  31.38 
 
 
435 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  31.14 
 
 
435 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  30.2 
 
 
442 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  30.85 
 
 
438 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  30.98 
 
 
435 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  30.72 
 
 
445 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  30.88 
 
 
435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.81 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  31.45 
 
 
435 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  29.1 
 
 
443 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  32.02 
 
 
435 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  28.81 
 
 
425 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  29.75 
 
 
435 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 
433 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  28.14 
 
 
430 aa  150  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  30.98 
 
 
435 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  31.38 
 
 
434 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.89 
 
 
430 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  27.89 
 
 
442 aa  150  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 
431 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.3 
 
 
435 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  31.38 
 
 
434 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.19 
 
 
446 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.3 
 
 
435 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.44 
 
 
435 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.3 
 
 
435 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 
431 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  28.9 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.25 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.86 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  31.21 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  30.77 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.05 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0055  adenylosuccinate lyase  29.06 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.07 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  30.32 
 
 
435 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  28 
 
 
431 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.98 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  29.11 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  31.47 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  30.36 
 
 
426 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  30.85 
 
 
438 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  28.17 
 
 
434 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  29.92 
 
 
431 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  29.92 
 
 
431 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  28.3 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>