More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2434 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  947    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  72.42 
 
 		 479 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  77.68 
 
 		 476 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  70.97 
 
 		 496 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  83.82 
 
 		 475 aa  797    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  84.82 
 
 		 476 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  73.64 
 
 		 474 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  74.89 
 
 		 481 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  72.36 
 
 		 475 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  71.01 
 
 		 476 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  73.78 
 
 		 477 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  73.78 
 
 		 475 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  73.4 
 
 		 472 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  76.73 
 
 		 476 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  73.73 
 
 		 472 aa  670    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  74.1 
 
 		 474 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  73 
 
 		 476 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  73.78 
 
 		 475 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 		 491 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  66.03 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.26 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  54.26 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.03 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.36 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.36 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 475 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  32.67 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  32.17 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.04 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  28.44 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  32.88 
 
 		 479 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  29.63 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  29.75 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  29.62 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.44 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  32.87 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  31.19 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  29.71 
 
 		 447 aa  159  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  30.46 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  30.61 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  32.25 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  32.18 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  32.25 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  32.01 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  32.5 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  31.7 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  32.43 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  31.76 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  27.52 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  31.34 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.2 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  27.63 
 
 		 430 aa  149  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  31.01 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  31.01 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  30.08 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  30.77 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  32.01 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  31.28 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  30.54 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  30.67 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  30.77 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  31.27 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.48 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  26.9 
 
 		 433 aa  143  8e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.75 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  30.08 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  30.08 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  29 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  32.5 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  32.16 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  33.16 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  32.41 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  27.98 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  27.84 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.95 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  29.6 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  27.83 
 
 		 442 aa  140  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  28.24 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  29.74 
 
 		 431 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  32.41 
 
 		 437 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  30.2 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0055  adenylosuccinate lyase  29 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  27.99 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  30.35 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.63 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  27.99 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>