More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1613 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  77.07 
 
 
476 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
481 aa  964    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  77.66 
 
 
475 aa  695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  84.11 
 
 
472 aa  806    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  71.94 
 
 
496 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 
476 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  74.52 
 
 
472 aa  674    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  90.53 
 
 
475 aa  861    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  74.95 
 
 
476 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  75.16 
 
 
475 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  90.74 
 
 
477 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  73 
 
 
474 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  72.51 
 
 
474 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  79.15 
 
 
479 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  74.89 
 
 
476 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  90.53 
 
 
475 aa  861    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  92.37 
 
 
491 aa  895    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  68.3 
 
 
476 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  71.01 
 
 
476 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  64.97 
 
 
475 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  58.17 
 
 
474 aa  520  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  55.11 
 
 
483 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  34.6 
 
 
499 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  33.99 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  30.99 
 
 
475 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.29 
 
 
479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.04 
 
 
483 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  31.18 
 
 
476 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.13 
 
 
476 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.13 
 
 
476 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  29.13 
 
 
479 aa  229  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  31.04 
 
 
473 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29.5 
 
 
476 aa  226  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  31.4 
 
 
477 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.62 
 
 
489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 
435 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  32.54 
 
 
435 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  30.51 
 
 
447 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 
435 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  33.67 
 
 
432 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  30.07 
 
 
447 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  32.3 
 
 
433 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  32.71 
 
 
435 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  32.3 
 
 
435 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  33.49 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 
434 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  31.14 
 
 
431 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 
438 aa  156  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  31.59 
 
 
435 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 
431 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  31.58 
 
 
435 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  32.47 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  28.37 
 
 
432 aa  154  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  28.04 
 
 
430 aa  153  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  30.56 
 
 
431 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.28 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  31.13 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  32.54 
 
 
433 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  32.54 
 
 
433 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  31.91 
 
 
435 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 
434 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 
430 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  31.58 
 
 
433 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 
438 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  29.98 
 
 
447 aa  150  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 
445 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  31.23 
 
 
431 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 
430 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  33.17 
 
 
435 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  30.67 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  31.43 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  29.61 
 
 
425 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  30.83 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.59 
 
 
433 aa  147  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  28.28 
 
 
431 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  28.28 
 
 
431 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  29.75 
 
 
461 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  30.17 
 
 
431 aa  147  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  29.75 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 
450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  31.63 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 
435 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 
442 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  30.42 
 
 
442 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  30.45 
 
 
443 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 
431 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  30.42 
 
 
442 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  32.22 
 
 
435 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  29.29 
 
 
438 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  30.33 
 
 
435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 
431 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>