More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0147 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  73.31 
 
 		 475 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 474 aa  946    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  73.04 
 
 		 475 aa  670    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  70.76 
 
 		 472 aa  654    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  74.12 
 
 		 476 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  70.91 
 
 		 479 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  75.58 
 
 		 472 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  70.04 
 
 		 496 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  73.47 
 
 		 475 aa  675    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  71.94 
 
 		 481 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  73.26 
 
 		 477 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  76.01 
 
 		 476 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  78.56 
 
 		 476 aa  719    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  96.2 
 
 		 474 aa  905    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  74.16 
 
 		 476 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  73.26 
 
 		 475 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  71.97 
 
 		 491 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  73.25 
 
 		 476 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  64.12 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  67.44 
 
 		 475 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  60.13 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  56.26 
 
 		 483 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  35.4 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.91 
 
 		 499 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 		 476 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  32.4 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  35.03 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 476 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  33.97 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  30.99 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  32.19 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  31.43 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  29.49 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 		 438 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  32.62 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  31.32 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 435 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  31.83 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  32.33 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  32.55 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  32.55 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  32.19 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  29.59 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  30.33 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.51 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  31.57 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  32.66 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  27.59 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.41 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  30.28 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.79 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.84 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.84 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  30.57 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.84 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.84 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.61 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.61 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  31.57 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.84 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.16 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  30.08 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  31.02 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  29.45 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  29.9 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  32.58 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  31.42 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  30.92 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  29.93 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  29 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  29.36 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  30.81 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  29.44 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  29.85 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  31.65 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.59 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  31.26 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  28.97 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  29.67 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  29.67 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  30.65 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  29.13 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  30.63 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>