More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2370 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  72.09 
 
 		 430 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 430 aa  892    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  65.35 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  62.79 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  65.58 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  60.7 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  61.63 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  60.23 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  58.37 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  58.37 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  58.8 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  58.8 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  57.67 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  57.67 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  58.84 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  58.56 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  56.28 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  56.98 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  56.84 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  57.08 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  57.08 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  57.08 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  56.28 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  58.6 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  57.65 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  56.15 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  57.65 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  55.99 
 
 		 438 aa  511  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  57.18 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  56.45 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  55.12 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  57.31 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  56.58 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  56.15 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  56.38 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  54.76 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  53.16 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 432 aa  502  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  56.68 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  53.36 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  52.09 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  54.76 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  56.24 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  55.43 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  55.2 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  54.33 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  54.8 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  54.33 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  54.73 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  53.94 
 
 		 432 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 		 431 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  53.81 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  53.81 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 		 431 aa  481  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  53.81 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  54.97 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 435 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  52.33 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  55.22 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  52.89 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  54.04 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  52.89 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>