More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0838 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  71.02 
 
 		 474 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  77.02 
 
 		 472 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  68.86 
 
 		 496 aa  649    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  76.11 
 
 		 475 aa  721    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  72.42 
 
 		 476 aa  675    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  79.15 
 
 		 481 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 479 aa  965    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  71.34 
 
 		 474 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  81.78 
 
 		 475 aa  752    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  77.43 
 
 		 476 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 476 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  71.4 
 
 		 472 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  78.44 
 
 		 477 aa  747    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 		 476 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  78.44 
 
 		 475 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  78.44 
 
 		 475 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  78.06 
 
 		 491 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  69.2 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  63.83 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 		 475 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  57.62 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.08 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  32.89 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.97 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  30.46 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.83 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 476 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  30.02 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  30.02 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  30.95 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  31.85 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29.72 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  29.46 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  30.04 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  31.09 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.6 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  31.41 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.01 
 
 		 434 aa  154  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  29.93 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 		 430 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  30.48 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  30.63 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  29.62 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  29.76 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  29.13 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  29.36 
 
 		 430 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  29.28 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  30.09 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  27.89 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.6 
 
 		 446 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  29.7 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  28.25 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  30.09 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  30.09 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  29.95 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  29.97 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  30.88 
 
 		 435 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  30.12 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  30.18 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  30.95 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  29.86 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 		 431 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  29.8 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  27.14 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 431 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  31.81 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  29.01 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  28.78 
 
 		 431 aa  143  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  27.83 
 
 		 434 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  29.49 
 
 		 431 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 432 aa  142  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.35 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  30.56 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  29.36 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  27.02 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  29.12 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  28.03 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  27.02 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.41 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.1 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  28.89 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  26.15 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  28.75 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  27.95 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>