More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6888 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  77.64 
 
 		 475 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  77.68 
 
 		 476 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  77.07 
 
 		 481 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  81.86 
 
 		 476 aa  763    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  76.03 
 
 		 474 aa  698    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  75.8 
 
 		 474 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  77.28 
 
 		 491 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  73.04 
 
 		 472 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  71.49 
 
 		 496 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  76.16 
 
 		 475 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  80 
 
 		 476 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  74.1 
 
 		 472 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  76.16 
 
 		 477 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  76.37 
 
 		 475 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  73.95 
 
 		 475 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  77.43 
 
 		 479 aa  741    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  68.35 
 
 		 476 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  73.05 
 
 		 476 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  67.09 
 
 		 475 aa  591  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  56.9 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.32 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  32.53 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  32.04 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.48 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 476 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  29.51 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  29.55 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.38 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  29.96 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 		 473 aa  217  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  29.57 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29 
 
 		 476 aa  213  7e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  30.6 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.33 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  32.11 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  30.97 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  31.52 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  32.15 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  31.52 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  31.43 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  30.9 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  31.29 
 
 		 435 aa  156  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  33.17 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  31.54 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  31.1 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  29.13 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.43 
 
 		 434 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  30.68 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  31.74 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  29.92 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.98 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  27.27 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.57 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  30.52 
 
 		 431 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.98 
 
 		 450 aa  150  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  31.75 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  30.51 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  30.73 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  32.22 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  29.51 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  28.89 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.53 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  30.03 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  31.5 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  30.82 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.53 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.37 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  26.68 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  26.56 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  30.6 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.28 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  27.61 
 
 		 438 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  30.84 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  29.12 
 
 		 431 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.12 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>