More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0219 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
432 aa  880    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  61.16 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  59.21 
 
 
431 aa  534  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  57.91 
 
 
431 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  57.67 
 
 
431 aa  522  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  52.2 
 
 
430 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
430 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
432 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  51.17 
 
 
431 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
431 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  51.86 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  51.17 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  51.86 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
435 aa  441  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
432 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
431 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 
431 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  48.38 
 
 
433 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
435 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
435 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 
430 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 
430 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 
431 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
431 aa  433  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 
431 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 
431 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  49.18 
 
 
431 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  45.94 
 
 
431 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 
432 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  50.24 
 
 
422 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 
436 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
431 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 
431 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  47.66 
 
 
436 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
434 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 
431 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  48.15 
 
 
434 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  47.66 
 
 
430 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  48.14 
 
 
437 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
431 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  49.27 
 
 
425 aa  418  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  46.73 
 
 
438 aa  418  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  49.52 
 
 
425 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
435 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
433 aa  420  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  47.34 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  47.56 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  45.83 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  47.43 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 
435 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
438 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  46.4 
 
 
435 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  45.94 
 
 
435 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  48.38 
 
 
434 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
433 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
434 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  46.64 
 
 
435 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  45.48 
 
 
435 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  45.92 
 
 
435 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
435 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  46.28 
 
 
432 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  47.56 
 
 
433 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  46.85 
 
 
433 aa  409  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  46.4 
 
 
436 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  45.24 
 
 
435 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  47.56 
 
 
433 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 
441 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 
431 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  47.69 
 
 
431 aa  411  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  46.64 
 
 
433 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>