More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2221 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  87.1 
 
 		 433 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  99.77 
 
 		 434 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  88.71 
 
 		 433 aa  789    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  73.5 
 
 		 435 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  87.56 
 
 		 433 aa  754    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  96.31 
 
 		 434 aa  862    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  76.5 
 
 		 435 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  82.03 
 
 		 435 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  75.12 
 
 		 435 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  74.48 
 
 		 435 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  84.53 
 
 		 450 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 434 aa  885    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  81.38 
 
 		 435 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  75.81 
 
 		 435 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  73.04 
 
 		 458 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  83.14 
 
 		 434 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  81.61 
 
 		 435 aa  718    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  76.04 
 
 		 445 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  76.04 
 
 		 435 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  73.73 
 
 		 435 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  73.5 
 
 		 435 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  83.37 
 
 		 434 aa  758    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  77.65 
 
 		 435 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  75.58 
 
 		 435 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  78.8 
 
 		 435 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  70.97 
 
 		 433 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  76.78 
 
 		 434 aa  693    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  73.56 
 
 		 432 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  89.38 
 
 		 438 aa  802    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  87.56 
 
 		 433 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  76.04 
 
 		 435 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  70.05 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  70.21 
 
 		 431 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  70.74 
 
 		 435 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  73.73 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  71.43 
 
 		 435 aa  618  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  71.33 
 
 		 437 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  70.51 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  72.08 
 
 		 438 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  72.15 
 
 		 438 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  71.66 
 
 		 435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  65.44 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  64.52 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  64.52 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 451 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  60.28 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  66.29 
 
 		 445 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  58.1 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  56.71 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  62.96 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  62.96 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  58.39 
 
 		 432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  60.28 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  60.14 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  60.05 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  60.36 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  59.59 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  54.29 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  56.98 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  54.29 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  54.28 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  54.06 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  53.47 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  53.48 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  53.7 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  53.7 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  53.48 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  52.48 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  51.85 
 
 		 438 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 		 451 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  52.7 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  52.7 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  52.48 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 		 438 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>