More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1285 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  79.26 
 
 		 434 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  79.03 
 
 		 445 aa  731    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  80 
 
 		 435 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  81.06 
 
 		 433 aa  720    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  80 
 
 		 435 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  81.84 
 
 		 435 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  78.16 
 
 		 435 aa  690    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  77.01 
 
 		 435 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  80 
 
 		 435 aa  721    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  78.85 
 
 		 435 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  78.8 
 
 		 434 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  79.45 
 
 		 434 aa  748    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  86.9 
 
 		 435 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  79.91 
 
 		 435 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  72.18 
 
 		 437 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  86.21 
 
 		 435 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  82.53 
 
 		 435 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  76.96 
 
 		 458 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  73.74 
 
 		 438 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  76.27 
 
 		 450 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  74.42 
 
 		 434 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  72.35 
 
 		 436 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  74.94 
 
 		 435 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  76.78 
 
 		 435 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  80.23 
 
 		 432 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  76.09 
 
 		 435 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  79.45 
 
 		 435 aa  720    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  79.45 
 
 		 433 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  74.25 
 
 		 434 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  74.32 
 
 		 438 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  895    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  78.8 
 
 		 434 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  81.06 
 
 		 433 aa  720    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  84.99 
 
 		 435 aa  789    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  73.21 
 
 		 431 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 435 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  72.58 
 
 		 431 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  79.31 
 
 		 438 aa  711    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  79.08 
 
 		 435 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  80.6 
 
 		 433 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  68.13 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 433 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  67.67 
 
 		 431 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  66.51 
 
 		 431 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  65.17 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 		 431 aa  584  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  67.34 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  59.35 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  57.41 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  56.71 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  62.3 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  61.11 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  58.03 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  61.11 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  58.11 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  61.05 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  60.36 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  56.15 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  60.82 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  56.61 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  60.59 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  55.26 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  55.45 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  55.26 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  55.26 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  54.73 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  57.21 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  53.59 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 		 430 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  54.71 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  54.38 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  52.93 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  53.94 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  54.25 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  53.14 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  53.13 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  54.27 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  53.47 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0055  adenylosuccinate lyase  55.48 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  55.06 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>