More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2128 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  67.86 
 
 
474 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  68.78 
 
 
475 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  68.58 
 
 
472 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
475 aa  952    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  67.46 
 
 
474 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  67.09 
 
 
476 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  66.46 
 
 
476 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  66.45 
 
 
476 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 
479 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  66.03 
 
 
476 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  65.75 
 
 
491 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  64.44 
 
 
477 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  64.97 
 
 
481 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  64.77 
 
 
475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  64.77 
 
 
475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  64.5 
 
 
475 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  64.33 
 
 
472 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  62.24 
 
 
476 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  61.68 
 
 
496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  64 
 
 
476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  56.48 
 
 
474 aa  527  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  55.3 
 
 
483 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  32.32 
 
 
475 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  34.51 
 
 
476 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.48 
 
 
499 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  35.53 
 
 
483 aa  250  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  31.08 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  31.08 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  30.69 
 
 
473 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 
476 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  31.59 
 
 
479 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.8 
 
 
479 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  32.97 
 
 
475 aa  227  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  30.53 
 
 
476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  31.95 
 
 
489 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  31.77 
 
 
477 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.96 
 
 
447 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 
435 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 
430 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.12 
 
 
435 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 
445 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 
430 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  30.49 
 
 
438 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  29.95 
 
 
431 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  31.59 
 
 
435 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 
447 aa  150  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 
435 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  28.97 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.28 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  30.65 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  31.25 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
434 aa  147  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  28.13 
 
 
433 aa  146  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  30 
 
 
435 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  32.11 
 
 
435 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.61 
 
 
430 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  30.13 
 
 
431 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 
461 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  26.95 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  29.62 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  31.44 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  27.41 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  28.17 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  30.02 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  30.1 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  29.55 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  31.68 
 
 
433 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.93 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  27.65 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  29.79 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  29.37 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  29.37 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  27.93 
 
 
442 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  27.16 
 
 
432 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  30.1 
 
 
435 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 
435 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  28.75 
 
 
435 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  27.38 
 
 
431 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.43 
 
 
431 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  28.19 
 
 
451 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  27.93 
 
 
442 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  25.94 
 
 
432 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  30.54 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  27.46 
 
 
431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  27.46 
 
 
431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  28.12 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  28.75 
 
 
435 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  29.15 
 
 
431 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  27.52 
 
 
427 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 
434 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 
426 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 
435 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 
431 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  28.75 
 
 
435 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  27.94 
 
 
451 aa  137  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 
435 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>