More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1648 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 431 aa  886    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  68.38 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  59.21 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  55.45 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  55.68 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  49.18 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  48.02 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  48.25 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  49.41 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  48.6 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  47.54 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  48.85 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  46.51 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  46.28 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  47.55 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  45.71 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  47.21 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  46.85 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  47.21 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  46.28 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  46.51 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  47.09 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  46.28 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  46.15 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  47.21 
 
 		 431 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  45.92 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  46.1 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  48.22 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  48.85 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  46.15 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  46.85 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  46.74 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  45.92 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  46.4 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  46.28 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  44.76 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  46.84 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0688  adenylosuccinate lyase  45.06 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930148  normal  0.150396 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  44.24 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  44.9 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  44.88 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  46.15 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  46.77 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  46.42 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  43.95 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  44.99 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  45.14 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  45.48 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  45.98 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  45.73 
 
 		 435 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  44.47 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  45.29 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  44.76 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  44.81 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  44.8 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  46.14 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  45.5 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  44.34 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  47.11 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  44.34 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  44.11 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  45.73 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  44.96 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  44.65 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  46.14 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  43.88 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  45.96 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  43.87 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>