More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4928 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
433 aa  882    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  60.7 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 
430 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  57.91 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  56.98 
 
 
431 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 
430 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 
430 aa  501  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  54.76 
 
 
431 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  54.04 
 
 
433 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 
435 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 
432 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 
434 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  55.68 
 
 
431 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 
431 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  54.29 
 
 
431 aa  481  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  54.52 
 
 
431 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  54.52 
 
 
431 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  53.49 
 
 
431 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  56.07 
 
 
437 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  53.72 
 
 
430 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 
422 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 
430 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  54.06 
 
 
431 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
431 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 
431 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 
451 aa  472  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
451 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 
451 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  54.06 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  52.78 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  52.46 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
432 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  53.36 
 
 
431 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
431 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 
431 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 
432 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
434 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  52.2 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  51.76 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  51.06 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 
431 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 
436 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
434 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
431 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 
430 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 
431 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 
431 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  48.38 
 
 
432 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  52.18 
 
 
439 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  52.64 
 
 
439 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
431 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  52.41 
 
 
439 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 
432 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  52.68 
 
 
435 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
435 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 
433 aa  428  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
445 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0688  adenylosuccinate lyase  48.74 
 
 
435 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930148  normal  0.150396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  47.56 
 
 
433 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 
439 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  47.43 
 
 
436 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  48.13 
 
 
431 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
433 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  45.92 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  48.85 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>