More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0688 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0688  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  877    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930148  normal  0.150396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  61.1 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  59.5 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  51.37 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  54.23 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  51.49 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  54 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.03 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  50.57 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  52.63 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  51.14 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  47.14 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  48.97 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  48.74 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  52.53 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  48.63 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  50.91 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  50.91 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  47.72 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  48.74 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  48.74 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  51.14 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  48.74 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  48.97 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  50.57 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  47.37 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  51.14 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  48.63 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  48.05 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  46.12 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  47.14 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  48.97 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  48.17 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  48.97 
 
 		 437 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  50.91 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  47.13 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  45.06 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  47.03 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  48.28 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  47.03 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  48.05 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  47.36 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  47.95 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  47.72 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  47.36 
 
 		 431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  45.31 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  48.4 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  46.91 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  47.95 
 
 		 436 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  46.19 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  46.45 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  46.8 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  47.83 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  46.35 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>