More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2064 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  87.47 
 
 		 431 aa  796    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 431 aa  892    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  86.54 
 
 		 431 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  87.7 
 
 		 431 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  87.01 
 
 		 431 aa  794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  70.23 
 
 		 431 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  69.37 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  68.59 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  68.13 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  68.82 
 
 		 433 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  68.82 
 
 		 433 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  67.05 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 435 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  66.59 
 
 		 438 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 434 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 434 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  65.44 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  64.29 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  66.51 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  64.58 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  64.2 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 435 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  62.12 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  63.13 
 
 		 450 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  63.49 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  62.82 
 
 		 435 aa  564  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  62.12 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  62.59 
 
 		 434 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  64.67 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 458 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  60 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  59.81 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  62.24 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  62.24 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  61.2 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  62.59 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  59.48 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  63.82 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  58.64 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  59.64 
 
 		 442 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  56.28 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  61.78 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  57.94 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  60.46 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  60.74 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  58.6 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  58.37 
 
 		 447 aa  531  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  59.04 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  58.5 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  58.28 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  57.82 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  57.6 
 
 		 443 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  58.28 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  56.78 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  58.35 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  55.12 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  59.27 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  58.51 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  58.58 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  58.51 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  55.58 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  58.51 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  53.74 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  58.89 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  60.09 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  56.41 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  55.3 
 
 		 438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  58.05 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  56.07 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 430 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  56.07 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  55.48 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 432 aa  511  1e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  57.74 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  55.12 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  56.38 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  54.57 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  57.77 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  54.57 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>