More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1887 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 431 aa  891    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  87.47 
 
 		 431 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  87.01 
 
 		 431 aa  794    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  98.61 
 
 		 431 aa  884    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  86.77 
 
 		 431 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  70 
 
 		 431 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  69.61 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 433 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  67.05 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  67.21 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  66.28 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  66.36 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  66.36 
 
 		 435 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  65.21 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  66.28 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  66.28 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  63.51 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  63.36 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  65.36 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  64.12 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  65.82 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 435 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  60.7 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  63.28 
 
 		 458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  62.12 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  61.66 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  60.28 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  61.66 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  62.7 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  62.7 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  63.49 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  63.97 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  63.97 
 
 		 435 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  63.97 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  57.67 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  59.58 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  61.84 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  61.66 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  58.55 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  56.51 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  56.28 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  56.51 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  60.64 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  61.1 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  57.91 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  56.51 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  57.94 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  60.87 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  60.87 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  59.27 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  57.11 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  57.47 
 
 		 443 aa  518  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  57.48 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  55.14 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  57.48 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  57.6 
 
 		 442 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  53.5 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  58.29 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  53.49 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  56.28 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  56.66 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  53.69 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  54.8 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  58.66 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  55.71 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  58.2 
 
 		 433 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  56.54 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  53.72 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  56.18 
 
 		 431 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  55.33 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  58.94 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  56.46 
 
 		 442 aa  501  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  57.54 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  58.92 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>