More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1145 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  71.59 
 
 		 435 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  72.75 
 
 		 433 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  70.23 
 
 		 431 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  70 
 
 		 431 aa  634    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  70 
 
 		 431 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  72.75 
 
 		 433 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  71.89 
 
 		 435 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  70.9 
 
 		 433 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  72.58 
 
 		 435 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  72.29 
 
 		 433 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  87.67 
 
 		 431 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 431 aa  893    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  70.05 
 
 		 438 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  70.9 
 
 		 435 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  69.28 
 
 		 434 aa  648    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  70.21 
 
 		 434 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  70.21 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  69.53 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  69.98 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  69.07 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  68.89 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  69.35 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  69.12 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  69.12 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  67.51 
 
 		 445 aa  614  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  67.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  69.21 
 
 		 432 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  69.05 
 
 		 435 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  67.05 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  67.67 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  67.66 
 
 		 437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  67.05 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  67.51 
 
 		 435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  69.59 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  66.59 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  69.59 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  66.36 
 
 		 436 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  68.89 
 
 		 435 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  65.44 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  65.67 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  65.9 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  63.66 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  66.51 
 
 		 438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  64.99 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  59.91 
 
 		 451 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  56.94 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  60.93 
 
 		 437 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  56.25 
 
 		 433 aa  538  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  60.32 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  56.98 
 
 		 430 aa  529  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  60.32 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  57.48 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  58.18 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  55.84 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  58.24 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  59.59 
 
 		 439 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  57.58 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  56.64 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  57.58 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  58.58 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  56.01 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 430 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  57.81 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  55.94 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  55.12 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  55.1 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  54.91 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  55.1 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  55.1 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  53.72 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  53.29 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  55.56 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  54.33 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  55.01 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  55.24 
 
 		 431 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 432 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  53.5 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  53.02 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  52.38 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>