More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1011 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  80.88 
 
 		 433 aa  718    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  78.57 
 
 		 435 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  80.88 
 
 		 433 aa  718    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  84.06 
 
 		 434 aa  765    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  72.87 
 
 		 435 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  72.81 
 
 		 435 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  73.56 
 
 		 435 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  83.14 
 
 		 434 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  83.37 
 
 		 434 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  77.7 
 
 		 435 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 435 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 435 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  72.41 
 
 		 435 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  88.25 
 
 		 434 aa  790    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  87.33 
 
 		 450 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  71.89 
 
 		 435 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 434 aa  893    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  71.26 
 
 		 432 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  74.25 
 
 		 435 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  81.11 
 
 		 433 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  81.11 
 
 		 433 aa  741    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  72.58 
 
 		 434 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  72.41 
 
 		 445 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  77.19 
 
 		 435 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  84.56 
 
 		 438 aa  774    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 435 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  69.89 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  71.49 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  70.8 
 
 		 435 aa  624  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  68.97 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  69.05 
 
 		 433 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  68.05 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  68.51 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  69.57 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  67.9 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  67.74 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  69.2 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  70.02 
 
 		 438 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  67.82 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  69.59 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  67.35 
 
 		 438 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  62.59 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  62.82 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  62.36 
 
 		 431 aa  554  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  63.05 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  58.43 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  59.55 
 
 		 451 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  62.39 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  56.45 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  56.45 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  57.27 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  58.31 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  58.54 
 
 		 439 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  57.31 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  58.54 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  54.06 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  51.27 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  52.48 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  52.25 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  52.48 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  52.58 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  51.84 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  50.9 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  51.5 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 		 451 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  47.7 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>