More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4343 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  73.67 
 
 		 434 aa  682    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  76.32 
 
 		 432 aa  690    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  74.83 
 
 		 433 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  76.09 
 
 		 435 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  73.9 
 
 		 433 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  80.65 
 
 		 445 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  84.14 
 
 		 435 aa  771    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  76.44 
 
 		 435 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  73.5 
 
 		 434 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  77.47 
 
 		 435 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  80.92 
 
 		 435 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  79.77 
 
 		 435 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  71.46 
 
 		 437 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  73.5 
 
 		 434 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  71.89 
 
 		 436 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  93.56 
 
 		 458 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  88.05 
 
 		 435 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  74.83 
 
 		 433 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  79.49 
 
 		 435 aa  730    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  93.1 
 
 		 435 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  84.83 
 
 		 435 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  73.17 
 
 		 438 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  74.19 
 
 		 434 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  76.78 
 
 		 435 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  80.46 
 
 		 435 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  79.77 
 
 		 435 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  74.36 
 
 		 433 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  80 
 
 		 435 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 435 aa  896    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  76.09 
 
 		 435 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  74.54 
 
 		 438 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  86.44 
 
 		 435 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  77.6 
 
 		 435 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  78.16 
 
 		 435 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  69.89 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  69.43 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  69.86 
 
 		 438 aa  621  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  70.11 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  67.44 
 
 		 433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  67.51 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  65.24 
 
 		 445 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  61.66 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  61.2 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  62.12 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  62.02 
 
 		 451 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  60.97 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  57.74 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  59.45 
 
 		 439 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  59.45 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  59.04 
 
 		 439 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  57.93 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  57.11 
 
 		 432 aa  501  1e-141  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  57.93 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  57.27 
 
 		 437 aa  494  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  52.7 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  51.35 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 		 434 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  52.79 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  51.57 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 		 431 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>