More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0331 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  64.83 
 
 
479 aa  636    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
476 aa  973    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  59.31 
 
 
475 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  58.11 
 
 
477 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  57.85 
 
 
476 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  57.63 
 
 
476 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  57.63 
 
 
476 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  58.44 
 
 
475 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  56.75 
 
 
473 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  56.01 
 
 
476 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  52.98 
 
 
499 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  52.63 
 
 
479 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  51.81 
 
 
483 aa  475  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  51.06 
 
 
489 aa  472  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  30.21 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  32.1 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  31.69 
 
 
472 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  30 
 
 
491 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 
476 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  29.5 
 
 
481 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 
476 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  29.72 
 
 
479 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  29 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  28.67 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 
475 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  29.55 
 
 
474 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 
477 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  31.17 
 
 
496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  29.71 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 
474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  29.37 
 
 
476 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 
476 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  30.38 
 
 
475 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  29.04 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 
430 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  29.91 
 
 
446 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  28.98 
 
 
445 aa  179  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  28.76 
 
 
447 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  29.48 
 
 
446 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 
430 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  27.9 
 
 
431 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  27.9 
 
 
431 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  29.45 
 
 
445 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  27.27 
 
 
446 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 
430 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  27.53 
 
 
431 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  28.57 
 
 
432 aa  163  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  27.5 
 
 
431 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  27.47 
 
 
446 aa  160  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  27.98 
 
 
448 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  26.48 
 
 
431 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 
434 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  27.45 
 
 
431 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  28.43 
 
 
431 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  26.48 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  27.58 
 
 
431 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  27.82 
 
 
431 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  25.68 
 
 
430 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  26.75 
 
 
431 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  26.8 
 
 
427 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 
431 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  26.12 
 
 
425 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 
435 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 
435 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.02 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  26.49 
 
 
431 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  26.75 
 
 
431 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 
435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 
435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  25.64 
 
 
422 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  26.9 
 
 
432 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  27.11 
 
 
435 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  27.11 
 
 
435 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  27.36 
 
 
435 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  27.11 
 
 
435 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  27.25 
 
 
430 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  27.11 
 
 
435 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  27.12 
 
 
431 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  25.61 
 
 
448 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  28.32 
 
 
431 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  27.84 
 
 
449 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  25.33 
 
 
447 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  24.33 
 
 
431 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  27.98 
 
 
435 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  27.11 
 
 
435 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  26.37 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  29.5 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  25.96 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  25.63 
 
 
431 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  27 
 
 
431 aa  147  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  26 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  25.81 
 
 
431 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  25.88 
 
 
431 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  25.88 
 
 
431 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>