More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1162 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
446 aa  915    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  43.68 
 
 
446 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  43.99 
 
 
446 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  44.25 
 
 
448 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  43.31 
 
 
445 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  43.72 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  42.53 
 
 
447 aa  356  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  43.79 
 
 
446 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  42.15 
 
 
449 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  43.12 
 
 
457 aa  339  5e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  42.83 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  42.38 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  40.76 
 
 
458 aa  330  4e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  42.89 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  42.6 
 
 
449 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  40.7 
 
 
448 aa  323  5e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  40.42 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  38.11 
 
 
431 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  38.11 
 
 
431 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  38.11 
 
 
431 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 
453 aa  299  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  39.26 
 
 
432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  37.88 
 
 
430 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  37.41 
 
 
431 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  39.26 
 
 
432 aa  286  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  38.64 
 
 
431 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  38.64 
 
 
431 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  39.49 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  37.64 
 
 
451 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  37.88 
 
 
431 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  37.88 
 
 
431 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  40.21 
 
 
431 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  39.72 
 
 
430 aa  279  9e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  37.41 
 
 
451 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  39.03 
 
 
431 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  39.08 
 
 
433 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  38.69 
 
 
430 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  37.89 
 
 
431 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  36.72 
 
 
451 aa  276  6e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  38.34 
 
 
430 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  37.65 
 
 
431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  37.98 
 
 
442 aa  274  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  37.12 
 
 
431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  39.16 
 
 
431 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  36.7 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  37.41 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  37.93 
 
 
435 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  37.93 
 
 
435 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  36.19 
 
 
431 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  35.55 
 
 
430 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
435 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  37.24 
 
 
435 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  36.79 
 
 
431 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  36.09 
 
 
435 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  37.24 
 
 
435 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  37.01 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  36.93 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  37.06 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  37.79 
 
 
422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  37.59 
 
 
431 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  39.7 
 
 
431 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  37.24 
 
 
435 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  37.06 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  36.67 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  36.32 
 
 
443 aa  266  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  35.78 
 
 
436 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 
433 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  36.39 
 
 
431 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  36.12 
 
 
431 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 
431 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  38.96 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  39.05 
 
 
431 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  35.23 
 
 
454 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  36.03 
 
 
431 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 
431 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  34.9 
 
 
443 aa  262  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  37.82 
 
 
430 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 
431 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  37.24 
 
 
431 aa  260  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  38.1 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  35.03 
 
 
438 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  35.6 
 
 
431 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  35.82 
 
 
431 aa  259  8e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  34.86 
 
 
431 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  36.16 
 
 
432 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  35.8 
 
 
431 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  34 
 
 
454 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  37.02 
 
 
435 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  35.54 
 
 
431 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  35.33 
 
 
431 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  36.93 
 
 
435 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  36.26 
 
 
447 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  36.61 
 
 
435 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  36.64 
 
 
433 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>