More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1351 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  67.34 
 
 		 461 aa  645    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  68.01 
 
 		 447 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  68.9 
 
 		 447 aa  654    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 448 aa  934    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  48.64 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  47.3 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  47.3 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  49.32 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  47.3 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  48.95 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  47.52 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  46.61 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  46.85 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  48.54 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  45.82 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  48.6 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  46.52 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  44.47 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  47.64 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  47.75 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  47.19 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  47.09 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  44.47 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  45.05 
 
 		 432 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  47.59 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  48.19 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  47.42 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  48.76 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  48.49 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  45.78 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  45.62 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  47.42 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  46.52 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  46.5 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  47.31 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  47.54 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  46.97 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 		 431 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  46.97 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  47.76 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  45.27 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  45.06 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  46.52 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  44.39 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  45.84 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  47.29 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  44.27 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  43.72 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  46.52 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  45.95 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  42.47 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  46.74 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  47.04 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  47.31 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  45.5 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  45.07 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  47.97 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>