More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0179 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 451 aa  917    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  76.75 
 
 		 445 aa  669    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  65.91 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  66.14 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  64.3 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  65.39 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  66.29 
 
 		 435 aa  591  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  65.17 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  65.92 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  64.94 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  65.91 
 
 		 433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  63.43 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  65.17 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  66.07 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  62.3 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  65.91 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  65.91 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  63.82 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  63.66 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  63.06 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  62.84 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  62.02 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  62.92 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  62.64 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  64.64 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  63.29 
 
 		 434 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  65.39 
 
 		 438 aa  557  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  59.91 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  60.67 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  62.02 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  65.62 
 
 		 435 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  62.61 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  60.72 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  62.92 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  59.55 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  59.78 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  59.78 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  56.21 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 		 432 aa  494  9.999999999999999e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  54.63 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  56.15 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  53.5 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  56.5 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  56.73 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  57.17 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  56.5 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 431 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 435 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 435 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  47.13 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  47.4 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  48.53 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  47.86 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  48.53 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  48.07 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  48.08 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  47.63 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  47.86 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  47.85 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 431 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  47.39 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  51.92 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  47.63 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  51.41 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 425 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  53.06 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  45.82 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>