More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4654 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  90.53 
 
 		 481 aa  861    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  74.24 
 
 		 476 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  75.69 
 
 		 475 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  78.44 
 
 		 479 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  84.84 
 
 		 472 aa  814    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  76.16 
 
 		 476 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  72.78 
 
 		 475 aa  682    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  73.78 
 
 		 476 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  71.37 
 
 		 496 aa  653    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 		 472 aa  675    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  74.11 
 
 		 474 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  75.32 
 
 		 476 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  99.79 
 
 		 477 aa  954    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  99.58 
 
 		 475 aa  952    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 475 aa  956    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  90.7 
 
 		 491 aa  861    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  73.26 
 
 		 474 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  65.96 
 
 		 476 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  69.94 
 
 		 476 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  64.77 
 
 		 475 aa  568  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.81 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  34.73 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  31.54 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.66 
 
 		 479 aa  236  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  29.96 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  31.05 
 
 		 473 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  29.96 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  28.91 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  29.91 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  29.31 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  30.17 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  31.72 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.7 
 
 		 489 aa  202  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  30.74 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  31.53 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  31.75 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  29.69 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  30.61 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.75 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  31.76 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  31.76 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.29 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  33.09 
 
 		 432 aa  153  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 		 438 aa  153  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.05 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  30.27 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  29.3 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  31.28 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  29.95 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  32.47 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  27.7 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  27.85 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  30.17 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  30.19 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  30.17 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  29.7 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  30.92 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.43 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  30.93 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.97 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  29.78 
 
 		 433 aa  147  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  30.54 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.4 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  29.7 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  27.47 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.6 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  31.46 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  27.34 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  31.22 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  29.85 
 
 		 445 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.43 
 
 		 431 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  31.21 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  30.3 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  29.44 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  27.88 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  30.83 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.11 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  27.66 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  27.57 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  27.57 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 		 431 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  28.33 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  29.05 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  27.93 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  29.32 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>