More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1402 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
483 aa  981    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  57.62 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  59.02 
 
 
474 aa  528  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  57.87 
 
 
475 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  56.9 
 
 
476 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  56.26 
 
 
474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  56.86 
 
 
474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  56.99 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  55.69 
 
 
475 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  57.68 
 
 
476 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  55.79 
 
 
476 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  55.11 
 
 
481 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  54.47 
 
 
472 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 
475 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 
477 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 
475 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  54.56 
 
 
491 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  54.04 
 
 
476 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  54.11 
 
 
476 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  54.32 
 
 
476 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  34.34 
 
 
476 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 
476 aa  269  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  32.91 
 
 
499 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  34.36 
 
 
475 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  31.74 
 
 
476 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  31.74 
 
 
476 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  33.18 
 
 
483 aa  248  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  32.75 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  32.37 
 
 
473 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  34.05 
 
 
479 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  32.1 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  30.85 
 
 
477 aa  233  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.7 
 
 
479 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  31.14 
 
 
489 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 
431 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  26.89 
 
 
451 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 
430 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  27.51 
 
 
430 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  32.3 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
432 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  26.65 
 
 
451 aa  153  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  29.18 
 
 
446 aa  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  28.47 
 
 
430 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  27.78 
 
 
448 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  26.29 
 
 
451 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  29.29 
 
 
431 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  27.44 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  29.81 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  27.14 
 
 
431 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 
431 aa  147  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  30.56 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  30.56 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 
430 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 
431 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  29.76 
 
 
446 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  27.71 
 
 
447 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 
430 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  29.22 
 
 
430 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  26.5 
 
 
431 aa  143  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  28.83 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  28.2 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  26.9 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  27.79 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  27.07 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  27.23 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  26.41 
 
 
431 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  26.41 
 
 
431 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  26.9 
 
 
448 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  26.41 
 
 
431 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  27.58 
 
 
435 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  26.97 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  25.33 
 
 
432 aa  137  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  27.53 
 
 
447 aa  136  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  29.05 
 
 
431 aa  136  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  25.77 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  27.03 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  25.77 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  23.79 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  26.55 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  27.91 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  25.59 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  29.61 
 
 
435 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  25.59 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  27.03 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  27.03 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  25.36 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  26.64 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  28.67 
 
 
438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  26.19 
 
 
432 aa  134  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  26.73 
 
 
432 aa  134  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  28.77 
 
 
436 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>