More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18087 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
499 aa  1041    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  61.32 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  61.32 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  60.18 
 
 
475 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  58.33 
 
 
476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  58.33 
 
 
479 aa  569  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  60.61 
 
 
475 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  57.24 
 
 
473 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 
476 aa  552  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  56.84 
 
 
477 aa  548  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  55.77 
 
 
483 aa  542  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  54.72 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  52.98 
 
 
476 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  51.65 
 
 
489 aa  513  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  34.9 
 
 
491 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  32.91 
 
 
483 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  34.41 
 
 
474 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  34.6 
 
 
481 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  33.91 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  35.29 
 
 
472 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  33.77 
 
 
476 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 
475 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 
477 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 
475 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  33.56 
 
 
475 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  34.98 
 
 
476 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  31.99 
 
 
476 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  32.8 
 
 
476 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 
472 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  32.89 
 
 
479 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  34.54 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  33.26 
 
 
496 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  32.13 
 
 
476 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  33.48 
 
 
475 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  31.46 
 
 
476 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  30.4 
 
 
474 aa  199  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  32.89 
 
 
445 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  31.84 
 
 
446 aa  189  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  30.62 
 
 
446 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  30.22 
 
 
448 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  30.57 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  28.08 
 
 
430 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 
430 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 
448 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.32 
 
 
431 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  30.51 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 
445 aa  166  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  28.82 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 
431 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
435 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  27.41 
 
 
447 aa  164  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
435 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
435 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
435 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 
435 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  29.15 
 
 
435 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 
430 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  26.81 
 
 
448 aa  162  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  29.57 
 
 
433 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  27.82 
 
 
431 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  27.82 
 
 
431 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  27.48 
 
 
431 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  30.42 
 
 
447 aa  160  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 
435 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.64 
 
 
431 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 
431 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  31.41 
 
 
431 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  26.65 
 
 
451 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  28.25 
 
 
438 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  28.45 
 
 
446 aa  156  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  26.4 
 
 
451 aa  156  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  25.63 
 
 
451 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  30.15 
 
 
434 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  28.39 
 
 
431 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 
435 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  26.55 
 
 
447 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  27.46 
 
 
432 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 
431 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  27.95 
 
 
431 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  27.95 
 
 
431 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  30.72 
 
 
449 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  30.51 
 
 
449 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  27.18 
 
 
433 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  27.82 
 
 
431 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  29.15 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  26.29 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  28.03 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  26.83 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  27.71 
 
 
436 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  26.13 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  26.96 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  25.95 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  26.87 
 
 
438 aa  146  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  29.41 
 
 
449 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  27.73 
 
 
431 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  27.09 
 
 
430 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>