More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1783 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  83.59 
 
 		 476 aa  767    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  80.25 
 
 		 476 aa  749    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  73.7 
 
 		 474 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  72.78 
 
 		 475 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  72.82 
 
 		 472 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  72.03 
 
 		 496 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  77.64 
 
 		 476 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  76.11 
 
 		 479 aa  721    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  75.16 
 
 		 481 aa  698    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  72.61 
 
 		 472 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  75.85 
 
 		 475 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  72.78 
 
 		 477 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  72.27 
 
 		 476 aa  685    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  74.15 
 
 		 474 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 475 aa  957    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  83.82 
 
 		 476 aa  783    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  74.11 
 
 		 476 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  72.78 
 
 		 475 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  74.37 
 
 		 491 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  68.78 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  57.96 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  55.69 
 
 		 483 aa  514  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  33.56 
 
 		 499 aa  263  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  31.58 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  31.58 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  34.37 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  32.06 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  30.21 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  31.98 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  32.97 
 
 		 483 aa  236  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  30.32 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  30.92 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  31.77 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  32.88 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  30.82 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  30.67 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  31.93 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  31.79 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  33.57 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  32.8 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  31 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  32.95 
 
 		 435 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  33.1 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  32.49 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  28.74 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  30.88 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.65 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  31.41 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  32.22 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  32.58 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  31.54 
 
 		 431 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  32.07 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  33.65 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  32.3 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  32.93 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  32.86 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  31.77 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  32.58 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  31.83 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  29.89 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  32.95 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  32.94 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  28.87 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  31.28 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  32.55 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  32.68 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  31.6 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  29.44 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  29.75 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  30.94 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  31.25 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  27.55 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  29.95 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  31.08 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0256  adenylosuccinate lyase  29.43 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  28.88 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  31.06 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  29.16 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  30.63 
 
 		 442 aa  150  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  31.09 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  31.12 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  32.38 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  31.39 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  28.27 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  28.54 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  28.61 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  28.19 
 
 		 431 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  31.01 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>