More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4341 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3624  adenylosuccinate lyase  71.73 
 
 		 475 aa  658    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1783  adenylosuccinate lyase  74.11 
 
 		 475 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38040  adenylosuccinate lyase  74.74 
 
 		 476 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6888  adenylosuccinate lyase  73.05 
 
 		 476 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1613  adenylosuccinate lyase  71.01 
 
 		 481 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0154  adenylosuccinate lyase  73.74 
 
 		 474 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0147  adenylosuccinate lyase  74.14 
 
 		 474 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6408  adenylosuccinate lyase  70.74 
 
 		 472 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2434  adenylosuccinate lyase  73 
 
 		 476 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114262  normal  0.241079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4439  adenylosuccinate lyase ; K01756 adenylosuccinate lyase  74.02 
 
 		 476 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00550594  hitchhiker  0.000234914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4341  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  946    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4654  adenylosuccinate lyase  69.94 
 
 		 475 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5145  adenylosuccinate lyase  70.17 
 
 		 491 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0838  adenylosuccinate lyase  69.2 
 
 		 479 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4566  adenylosuccinate lyase  69.73 
 
 		 477 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4949  adenylosuccinate lyase  69.94 
 
 		 475 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10792  adenylosuccinate lyase  68.91 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.99152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5086  adenylosuccinate lyase  67.86 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0580  adenylosuccinate lyase  65.19 
 
 		 476 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194315  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2128  adenylosuccinate lyase  64 
 
 		 475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1941  adenylosuccinate lyase  58.95 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324214  normal  0.0794487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1402  adenylosuccinate lyase  54.32 
 
 		 483 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0723  adenylosuccinate lyase  31.03 
 
 		 475 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3831  adenylosuccinate lyase  32.09 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18087  adenylosuccinate lyase  31.33 
 
 		 499 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84718  3-isopropylmalate dehydratase  32.96 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000783625  normal  0.0902341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1129  adenylosuccinate lyase  30.65 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1640  adenylosuccinate lyase  29.02 
 
 		 476 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1922  adenylosuccinate lyase  29.02 
 
 		 476 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03070  adenylosuccinate lyase, putative  31.98 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1620  adenylosuccinate lyase  30.24 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2150  adenylosuccinate lyase  29.19 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0326846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3043  adenylosuccinate lyase  29.96 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0741  adenylosuccinate lyase  29.1 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000408437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0331  adenylosuccinate lyase  28.92 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06209  adenylosuccinate lyase (Eurofung)  29.36 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  28.9 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  29.68 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  31.14 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00300  Adenylosuccinate lyase  29.52 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  31.39 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01290  Adenylosuccinate lyase  29.3 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  31.37 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  29.35 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  31.49 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  31.13 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  28.21 
 
 		 430 aa  153  8e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  29.67 
 
 		 432 aa  153  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  28.35 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  28.35 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  27.66 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  29.97 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  30.26 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  31.33 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  31.39 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  29.82 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  28.81 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  29.34 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  31.39 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  30.64 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  29.18 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  28.79 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  28.1 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  29.11 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  29.03 
 
 		 435 aa  148  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  29.1 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  29.1 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  30.38 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  30.75 
 
 		 431 aa  147  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  27.47 
 
 		 446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  29.59 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  28.93 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  30.58 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  30.9 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  29.57 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  28.68 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  29.18 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  28.51 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  30.37 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  29.4 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  30.17 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  28.25 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  28.5 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  29.48 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  29.8 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  29.87 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  29.18 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  27.79 
 
 		 448 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  29.86 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1351  adenylosuccinate lyase  28.29 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0804314  normal  0.668608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>