More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0996 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  71.46 
 
 
431 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  71.69 
 
 
431 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
431 aa  892    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  75.41 
 
 
431 aa  700    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  76.1 
 
 
431 aa  708    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  71.69 
 
 
431 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  77.49 
 
 
431 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  98.84 
 
 
431 aa  884    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  73.78 
 
 
431 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  78.19 
 
 
431 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  68.91 
 
 
431 aa  628  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  66.82 
 
 
431 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  66.82 
 
 
431 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  63.34 
 
 
431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  64.04 
 
 
431 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  63.34 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  63.57 
 
 
431 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  64.45 
 
 
422 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  54.99 
 
 
430 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
431 aa  485  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
430 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
434 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  54.52 
 
 
431 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
430 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  55.01 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  55.01 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  53.15 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
431 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  51.52 
 
 
437 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  48.49 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.5 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  48.73 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  48.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.5 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  51.85 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  50.91 
 
 
443 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  48.04 
 
 
435 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
435 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
445 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  48.41 
 
 
442 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 
451 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 
431 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 
431 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
434 aa  435  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
435 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
435 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
430 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 
435 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
435 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
433 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
433 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 
451 aa  435  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
451 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
435 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
434 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
439 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
435 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
434 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
433 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 
435 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
435 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
442 aa  431  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
432 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
435 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  50.37 
 
 
425 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
430 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 
431 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
434 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
435 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  49.09 
 
 
447 aa  425  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 
435 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  47.69 
 
 
458 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>