More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1558 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  71.69 
 
 
431 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  97.45 
 
 
431 aa  842    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  71.69 
 
 
431 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  72.16 
 
 
431 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  68.91 
 
 
431 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  67.98 
 
 
431 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
431 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  70.77 
 
 
431 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  97.45 
 
 
431 aa  868    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  88.4 
 
 
431 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  64.5 
 
 
431 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  64.5 
 
 
431 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  64.04 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  61.48 
 
 
431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  61.72 
 
 
431 aa  589  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  61.72 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  62.09 
 
 
422 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  61.48 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.52 
 
 
431 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
431 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
431 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 
430 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
430 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 
431 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 
431 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  54.55 
 
 
435 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  53.13 
 
 
434 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  54.55 
 
 
435 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 
430 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
431 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
431 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  51.61 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  51.38 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  51.15 
 
 
435 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 
430 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 
431 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  51.15 
 
 
435 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
435 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  51.15 
 
 
435 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
431 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
430 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  448  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  448  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  48.26 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  49.09 
 
 
443 aa  443  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  49.09 
 
 
442 aa  444  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  47.95 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
435 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  46.64 
 
 
451 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  48.86 
 
 
447 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  46.87 
 
 
451 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 
437 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  48.61 
 
 
445 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  47.33 
 
 
432 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  45.94 
 
 
451 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 
435 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 
432 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
425 aa  428  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
435 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  47.1 
 
 
432 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  47.61 
 
 
442 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  50.62 
 
 
427 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
435 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  47.79 
 
 
431 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  47.27 
 
 
443 aa  426  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 
434 aa  425  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 
435 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
435 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  47.09 
 
 
438 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
439 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  49.52 
 
 
434 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  47.45 
 
 
434 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  48.29 
 
 
442 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  47.71 
 
 
439 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  48.61 
 
 
436 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 
434 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  48.6 
 
 
433 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  47.45 
 
 
435 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  47.45 
 
 
434 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  46.62 
 
 
431 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  47.67 
 
 
432 aa  422  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  49.15 
 
 
425 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  47.55 
 
 
430 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  47.45 
 
 
433 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  47.09 
 
 
431 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
435 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0156814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>