More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0161 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0129  fumarate lyase  79.3 
 
 		 408 aa  659    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0147  adenylosuccinate lyase  79.3 
 
 		 403 aa  651    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0520722  normal  0.203508 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1197  adenylosuccinate lyase  78.25 
 
 		 403 aa  654    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0161  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 406 aa  823    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.576792  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  45.05 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  45.07 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  36.82 
 
 		 453 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  37.72 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  34.7 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  36.57 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  35.22 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  34.39 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  33.82 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  35.73 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  39.02 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  36.87 
 
 		 435 aa  229  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  39.14 
 
 		 435 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  37.3 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  36.43 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  37.78 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  34.58 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  35.54 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  38.34 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  35.09 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  37.37 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  36.19 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  35.12 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0818  adenylosuccinate lyase  38.07 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  36.48 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  37.53 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1058  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  35.37 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  34.3 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  37.4 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  36.68 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0766  adenylosuccinate lyase  29.66 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.401492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  35.39 
 
 		 443 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  34.66 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  33.82 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  37 
 
 		 431 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  37 
 
 		 431 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  36.8 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  35.22 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  34.31 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  32.69 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  36.34 
 
 		 435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  36.34 
 
 		 435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  34.2 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  35.09 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  33.75 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  35.92 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  36.07 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  35.26 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  36.1 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  36 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  36.48 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  36.53 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  36.18 
 
 		 433 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  35.9 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  36.63 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  35.01 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  34.32 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  34.8 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  34.25 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  36.27 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  33.82 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  35.64 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  35.11 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  33.94 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  33.96 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  36.17 
 
 		 446 aa  209  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  38.58 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  34.66 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  35.13 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  33.92 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  36.8 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  35.4 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  34.84 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2293  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.0141392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  35.12 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  34.09 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>