More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1597 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  50.15 
 
 		 669 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 651 aa  1345    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  52.18 
 
 		 662 aa  673    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  35.23 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 701 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 709 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 714 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  28.05 
 
 		 733 aa  237  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 		 689 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 582 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 		 673 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 		 680 aa  188  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.43 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.08 
 
 		 656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 		 670 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 583 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.42 
 
 		 657 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 653 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  26.28 
 
 		 708 aa  174  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 		 579 aa  174  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  26.65 
 
 		 657 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.34 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 631 aa  171  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  28.41 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  26.26 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 		 578 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 654 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  26.2 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 		 582 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 		 673 aa  168  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 727 aa  167  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  25.89 
 
 		 656 aa  167  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 		 583 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 680 aa  167  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 		 675 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  25.84 
 
 		 711 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  26.32 
 
 		 719 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  25.27 
 
 		 723 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 		 638 aa  163  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  26.55 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  27.94 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.19 
 
 		 649 aa  161  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 		 578 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  27.77 
 
 		 727 aa  160  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 578 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  26.25 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.04 
 
 		 645 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  26.19 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  26.13 
 
 		 579 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  30.11 
 
 		 663 aa  158  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 657 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 657 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  25.96 
 
 		 579 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  26.02 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  24.01 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  26.02 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  27.54 
 
 		 581 aa  157  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  26.02 
 
 		 583 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  26.02 
 
 		 583 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 575 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  27.09 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  25.19 
 
 		 705 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  26.28 
 
 		 682 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  28.22 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  25.52 
 
 		 580 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 		 592 aa  154  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  26.13 
 
 		 583 aa  154  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 		 613 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 		 649 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  26.78 
 
 		 622 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  25.79 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  26.9 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2628  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 		 655 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.19 
 
 		 708 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.65 
 
 		 635 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 		 553 aa  150  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.23 
 
 		 644 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.12 
 
 		 662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  25.65 
 
 		 716 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  27.85 
 
 		 568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  29.91 
 
 		 570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  26.47 
 
 		 600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  25.81 
 
 		 739 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>