More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3521 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
714 aa  1471    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.79 
 
 
709 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  43.4 
 
 
701 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  40.59 
 
 
704 aa  522  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
697 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
701 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  34.75 
 
 
662 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 
669 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  32.23 
 
 
733 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
651 aa  317  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 
689 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 
654 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 
684 aa  217  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  28.57 
 
 
660 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 
662 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 
673 aa  213  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  27.71 
 
 
711 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
680 aa  210  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  27.82 
 
 
657 aa  210  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.06 
 
 
657 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
657 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  28.49 
 
 
721 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  27.51 
 
 
682 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
680 aa  204  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  27.53 
 
 
657 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  28.22 
 
 
728 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 
653 aa  201  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 
582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 
656 aa  198  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  28.31 
 
 
656 aa  194  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 
670 aa  194  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.9 
 
 
695 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  26.92 
 
 
727 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.24 
 
 
713 aa  190  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  27.32 
 
 
727 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
727 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 
571 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.14 
 
 
609 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 
578 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 
705 aa  185  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  26.65 
 
 
631 aa  185  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 
655 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 
754 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 
607 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 
710 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 
673 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
589 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  26.56 
 
 
708 aa  181  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 
638 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  26.75 
 
 
740 aa  178  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  27.12 
 
 
739 aa  177  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.76 
 
 
670 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  26.16 
 
 
739 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 
603 aa  175  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  28.46 
 
 
663 aa  174  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
578 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
553 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.19 
 
 
578 aa  173  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.43 
 
 
703 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.15 
 
 
704 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.13 
 
 
702 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.83 
 
 
708 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  25.73 
 
 
729 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 
614 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  25.17 
 
 
723 aa  170  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 
649 aa  170  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.34 
 
 
654 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 
610 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.23 
 
 
583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.47 
 
 
566 aa  168  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 
581 aa  168  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.49 
 
 
583 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  29.32 
 
 
644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  28.24 
 
 
622 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  27.59 
 
 
578 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  30.36 
 
 
570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 
692 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  26.26 
 
 
645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
649 aa  164  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.6 
 
 
716 aa  164  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.45 
 
 
581 aa  164  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
613 aa  164  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 
613 aa  163  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.39 
 
 
672 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
582 aa  163  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  26.97 
 
 
583 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
582 aa  163  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  26.97 
 
 
583 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  26.57 
 
 
597 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  27.86 
 
 
638 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  27.86 
 
 
638 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  26.1 
 
 
579 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  26.8 
 
 
583 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  27.86 
 
 
638 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  26.13 
 
 
734 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 
578 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  27.29 
 
 
601 aa  161  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 
583 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>