More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6973 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 701 aa  1452    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.41 
 
 		 697 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  39.31 
 
 		 701 aa  507  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  37.71 
 
 		 662 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  35.48 
 
 		 704 aa  478  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 		 669 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  35.47 
 
 		 733 aa  415  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 709 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 714 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 651 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 689 aa  243  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.97 
 
 		 680 aa  233  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 		 684 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 		 673 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 680 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  27.48 
 
 		 673 aa  218  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  26.83 
 
 		 713 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 		 670 aa  210  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.25 
 
 		 657 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  27.92 
 
 		 711 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.23 
 
 		 682 aa  207  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.91 
 
 		 657 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.84 
 
 		 582 aa  204  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 		 656 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 654 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.36 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 		 662 aa  201  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  27.35 
 
 		 708 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  26.72 
 
 		 657 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  28.07 
 
 		 660 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  27.24 
 
 		 663 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 		 631 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  27.34 
 
 		 705 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  29.72 
 
 		 645 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.67 
 
 		 649 aa  190  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 717 aa  190  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  28.32 
 
 		 622 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  25.87 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.87 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 		 613 aa  181  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 		 727 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 653 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 578 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 638 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  25.84 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 		 649 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.49 
 
 		 672 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  26.3 
 
 		 740 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  27.46 
 
 		 580 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.23 
 
 		 645 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 		 710 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  25.5 
 
 		 723 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 		 699 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  28.06 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  26.92 
 
 		 716 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.87 
 
 		 578 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 		 553 aa  171  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  24.54 
 
 		 734 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 		 657 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.03 
 
 		 730 aa  170  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  25.59 
 
 		 708 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 		 589 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  25.39 
 
 		 719 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  27.24 
 
 		 580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 		 578 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.62 
 
 		 737 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.43 
 
 		 703 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 571 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 		 576 aa  167  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  28.3 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 		 583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 		 582 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  27.48 
 
 		 577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 		 578 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  25.95 
 
 		 699 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  26.05 
 
 		 716 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  28.13 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  26.69 
 
 		 575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  26.15 
 
 		 699 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 		 570 aa  164  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  26.47 
 
 		 581 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 		 582 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  27.16 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  26.05 
 
 		 716 aa  163  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  24.31 
 
 		 727 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  24.93 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  25.95 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  25.95 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 		 702 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.3 
 
 		 607 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>