More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06545 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.18 
 
 		 651 aa  673    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  57.42 
 
 		 669 aa  808    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  100 
 
 		 662 aa  1372    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.61 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  38.98 
 
 		 704 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.71 
 
 		 701 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  37.99 
 
 		 701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 709 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 714 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  29.99 
 
 		 733 aa  342  9e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 689 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.82 
 
 		 657 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.97 
 
 		 657 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 670 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 673 aa  238  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 		 684 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 		 631 aa  227  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.3 
 
 		 713 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  27.74 
 
 		 695 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  28.12 
 
 		 708 aa  223  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 		 654 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  27.99 
 
 		 660 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  31.64 
 
 		 663 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 656 aa  216  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  27.23 
 
 		 728 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.37 
 
 		 719 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 653 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 		 657 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  26.9 
 
 		 721 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 638 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.26 
 
 		 662 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  26.66 
 
 		 711 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 613 aa  205  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  26.24 
 
 		 657 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.19 
 
 		 656 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  26.34 
 
 		 723 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 		 655 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 839 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 		 586 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 		 705 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  27.9 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  26.21 
 
 		 740 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.03 
 
 		 672 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 		 614 aa  195  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  27.71 
 
 		 603 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  25.76 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  26.28 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 		 699 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 		 570 aa  187  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  28.79 
 
 		 583 aa  187  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  27.14 
 
 		 716 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  27.23 
 
 		 646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  28.72 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  28.69 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  28.74 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  26.25 
 
 		 682 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 563 aa  186  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.852726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  28.69 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 727 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 		 584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 		 729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  26.03 
 
 		 727 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 584 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 584 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 584 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  26.93 
 
 		 690 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  27.3 
 
 		 708 aa  183  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 		 583 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.95 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 699 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 		 635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.5 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 		 644 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  28.19 
 
 		 645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 		 578 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  27.07 
 
 		 587 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  26.99 
 
 		 699 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  27.31 
 
 		 644 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 		 578 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  26.99 
 
 		 716 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  25.91 
 
 		 712 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>