More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0944 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0944  NOL1/NOP2/sun family protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0664  NOL1/NOP2/sun family protein  62.32 
 
 		 279 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0739  NOL1/NOP2/sun family protein  61.59 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1122  NOL1NOP2sun family protein  47.22 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0392617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2749  NOL1/NOP2/sun family protein  33 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.46 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.04 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.78 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  31.69 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.33 
 
 		 446 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.31 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.57 
 
 		 447 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  28.01 
 
 		 451 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.84 
 
 		 448 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  35.07 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.77 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 		 438 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.29 
 
 		 470 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.61 
 
 		 452 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  29.3 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  30.46 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.3 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.75 
 
 		 451 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.21 
 
 		 453 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.39 
 
 		 443 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  30.98 
 
 		 695 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.1 
 
 		 444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  27.9 
 
 		 443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  29.68 
 
 		 452 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  31.51 
 
 		 625 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1541  RNA methylase  34.08 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.66 
 
 		 435 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.65 
 
 		 454 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.05 
 
 		 503 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  28.93 
 
 		 451 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.73 
 
 		 446 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.58 
 
 		 444 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.15 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.16 
 
 		 454 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.84 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.71 
 
 		 503 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  32.74 
 
 		 442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  29.74 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.22 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  28.95 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.39 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  29.52 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  31.7 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.84 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.42 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.08 
 
 		 444 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.23 
 
 		 417 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 449 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0378  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  33.7 
 
 		 265 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0306061 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  29.9 
 
 		 788 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  31.77 
 
 		 528 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.27 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.39 
 
 		 442 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.07 
 
 		 444 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.25 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  32.83 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  32.83 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  32.83 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  32.83 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  32.59 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0458  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  34.83 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  32.08 
 
 		 444 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.89 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.77 
 
 		 481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.15 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32.17 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  29.28 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.58 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  39.38 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.09 
 
 		 481 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.09 
 
 		 481 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35 
 
 		 501 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.35 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.35 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  36.87 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.91 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.62 
 
 		 481 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.37 
 
 		 486 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  35 
 
 		 478 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  27.16 
 
 		 471 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30.7 
 
 		 453 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.76 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  35.19 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  29.62 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  35.65 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.65 
 
 		 481 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.65 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  30.13 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  30.51 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.87 
 
 		 448 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.09 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  35.65 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.03 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.25 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.09 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>