243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2970 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2970  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  68.54 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3143  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.5 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.343302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3982  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.43 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.549052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.36 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2423  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.13 
 
 		 254 aa  275  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.217183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35250  rRNA methylase  68.95 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.925094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4172  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.76 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3914  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.83 
 
 		 250 aa  254  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2449  tRNA/rRNA methyltransferase  67.49 
 
 		 227 aa  254  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5159  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.35 
 
 		 224 aa  254  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38470  rRNA methylase  65.84 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.66 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0504  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.77 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0733  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.37 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.34 
 
 		 207 aa  247  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.435122  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10385  RNA methyltransferase  64.68 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.85641e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.37 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0482  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.19 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0493  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.19 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.490005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0471  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.2 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25750  rRNA methylase  60 
 
 		 208 aa  224  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0657  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.61 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05640  rRNA methylase  62.15 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.480906  normal  0.641593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.11 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4352  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.13 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.2 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.19 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0099  RNA methyltransferase, TrmH family  45.1 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.167605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1208  rRNA methylase  48.09 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28928  predicted protein  30.71 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  26.03 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  27.95 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  28.83 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  28.22 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.57 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.33 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.84 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  30.96 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.93 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.28 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  32.33 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.09 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3524  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.26 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.68 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.62 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  26.38 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.87 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.38 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.14 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  27.74 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  26.92 
 
 		 320 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.73 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  28.4 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.15 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.82 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4596  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  22.78 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  28.97 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.19 
 
 		 333 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  25.32 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4434  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.27 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  30.61 
 
 		 322 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.79 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.17 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.87 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.15 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1205  SpoU rRNA methylase family protein  28.66 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000205197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.92 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.73 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  24.4 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.23 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.34 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.27 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.87 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.49 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8152  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.12 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  27.75 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2876  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  22.78 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.58 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.72 
 
 		 363 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2638  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.45 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.56 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.734552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.68 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.68 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.25 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.51 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  22.96 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12053  predicted protein  25.15 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00023289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>