188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3143 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3143  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.343302  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  65.12 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2970  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68.7 
 
 		 219 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3982  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.13 
 
 		 213 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.549052  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2423  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.67 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.217183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05640  rRNA methylase  62.93 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.480906  normal  0.641593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4172  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.09 
 
 		 212 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2449  tRNA/rRNA methyltransferase  61.4 
 
 		 227 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.66 
 
 		 205 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.84 
 
 		 222 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35250  rRNA methylase  61.61 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.925094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5159  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.7 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3914  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.58 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.09 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.435122  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0504  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.75 
 
 		 232 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0733  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.14 
 
 		 207 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0482  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.13 
 
 		 214 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0493  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.13 
 
 		 214 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.490005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0471  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.13 
 
 		 214 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25750  rRNA methylase  60 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38470  rRNA methylase  55.35 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10385  RNA methyltransferase  55.61 
 
 		 220 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.85641e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.86 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.74 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0657  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.7 
 
 		 229 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4352  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.4 
 
 		 219 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.05 
 
 		 215 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0099  RNA methyltransferase, TrmH family  40.16 
 
 		 268 aa  179  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.167605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1208  rRNA methylase  43.8 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28928  predicted protein  27.04 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.07 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.72 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.41 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.68 
 
 		 349 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  26.11 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.16 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  27.33 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.95 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  27.95 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  30.82 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.01 
 
 		 724 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  19.87 
 
 		 161 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.95 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.48 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  28.84 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5505  putative tRNA/rRNA methyltransferase  28.92 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121467  normal  0.0712484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  29.33 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  28.73 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  30 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.87 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  27.22 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.62 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.36 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  27.53 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0053  tRNA/rRNA methyltransferase  21.88 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.54 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  27.53 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.6 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  32.9 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  22.62 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.3 
 
 		 542 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.65 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  26.47 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  26.22 
 
 		 180 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9079  rRNA methylase protein  29.21 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.72 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  26.97 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.77 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  22.7 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.77 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.53 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  23.6 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.88 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  29.56 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  29.05 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.75 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.29 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01575  hypothetical protein  33.77 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.75 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  29.33 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.19 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  22.81 
 
 		 171 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.57 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.282082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1157  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.19 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0146  RNA methylase  23.32 
 
 		 176 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  32.08 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>