More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3629 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.86 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.69 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.38 
 
 
250 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  47.06 
 
 
245 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.06 
 
 
246 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  44.73 
 
 
242 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  41.84 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.84 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45 
 
 
256 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.17 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.33 
 
 
256 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.98 
 
 
246 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.57 
 
 
306 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  42.92 
 
 
245 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.33 
 
 
292 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.33 
 
 
292 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  41.37 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  41.96 
 
 
373 aa  164  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  42.06 
 
 
372 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  37.76 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.47 
 
 
310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  42.08 
 
 
238 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  40.56 
 
 
314 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.97 
 
 
267 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.7 
 
 
246 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.32 
 
 
316 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.24 
 
 
261 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.25 
 
 
245 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.4 
 
 
251 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.42 
 
 
247 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
243 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  34.45 
 
 
247 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.75 
 
 
246 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.17 
 
 
240 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  36.13 
 
 
244 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 
253 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.68 
 
 
237 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.91 
 
 
322 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0685  rRNA methyltranferase  41.67 
 
 
246 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
247 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.59 
 
 
246 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.33 
 
 
245 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  39.89 
 
 
251 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.86 
 
 
387 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.79 
 
 
326 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  32.66 
 
 
289 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35 
 
 
247 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.08 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.65 
 
 
255 aa  151  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  35.42 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.02 
 
 
246 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  36.74 
 
 
323 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.6 
 
 
315 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  32.26 
 
 
289 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.78 
 
 
246 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  41.74 
 
 
320 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  33.89 
 
 
277 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  40.66 
 
 
322 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.17 
 
 
247 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.43 
 
 
255 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  35.71 
 
 
234 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.22 
 
 
246 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.79 
 
 
327 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.18 
 
 
248 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2232  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.98 
 
 
256 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.78 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  40.08 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  35 
 
 
251 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.18 
 
 
255 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.91 
 
 
252 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  39.08 
 
 
246 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  37.05 
 
 
253 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.22 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.66 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.32 
 
 
326 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.74 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.92 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  38.82 
 
 
244 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0991  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase, putative  39.91 
 
 
255 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.5 
 
 
321 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  39.81 
 
 
242 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  39.81 
 
 
242 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  36.21 
 
 
249 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1105  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.91 
 
 
255 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.919918  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  40.93 
 
 
312 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  36.25 
 
 
263 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.32 
 
 
234 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1295  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.76 
 
 
247 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.05 
 
 
234 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1765  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.86 
 
 
271 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.560778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>