More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0856 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  100 
 
 
397 aa  799    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  69.77 
 
 
349 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  69.92 
 
 
382 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  69.42 
 
 
383 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  64.52 
 
 
388 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  63.43 
 
 
388 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  62.59 
 
 
395 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  63.84 
 
 
366 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  58.9 
 
 
345 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  58.15 
 
 
365 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  57.21 
 
 
345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  58.15 
 
 
345 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  58.15 
 
 
345 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  58.15 
 
 
345 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  58.15 
 
 
345 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  44.97 
 
 
333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  42.86 
 
 
364 aa  212  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.57 
 
 
278 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  37.61 
 
 
240 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.06 
 
 
250 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  31.95 
 
 
255 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.32 
 
 
652 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  30.66 
 
 
282 aa  99.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.95 
 
 
250 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.75 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  32.39 
 
 
250 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.65 
 
 
542 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.1 
 
 
246 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  30.45 
 
 
252 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.69 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.54 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.69 
 
 
246 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
268 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  29.95 
 
 
268 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  29.92 
 
 
251 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  31.58 
 
 
245 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.99 
 
 
268 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.16 
 
 
232 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.61 
 
 
240 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.6 
 
 
239 aa  90.1  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  31.58 
 
 
323 aa  90.1  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.49 
 
 
267 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.53 
 
 
348 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  27.87 
 
 
288 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.68 
 
 
234 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.96 
 
 
247 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.24 
 
 
269 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.43 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.55 
 
 
326 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.44 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.03 
 
 
248 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  30.04 
 
 
536 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.13 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.12 
 
 
246 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.44 
 
 
442 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  32.21 
 
 
314 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.3 
 
 
246 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.1 
 
 
327 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.76 
 
 
316 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.32 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  31.72 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  27.78 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.51 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  32.84 
 
 
314 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.54 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  28.86 
 
 
251 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.17 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  33.78 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.17 
 
 
324 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.57 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.63 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.2 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.96 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  30 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  33.8 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.71 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.34 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.29 
 
 
259 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.24 
 
 
243 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.51 
 
 
249 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.85 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.86 
 
 
246 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.36 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.67 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.75 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.97 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  28.65 
 
 
247 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.36 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.65 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  30.34 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>