84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1953 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  100 
 
 		 96 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  52.53 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  50.53 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  48.35 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  47.25 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  44.57 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  47.31 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  45.16 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  45.56 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  42.71 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  45.74 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  44.57 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  40.23 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  45.05 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  40.74 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  40.74 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  40.74 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  39.51 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  40.74 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  39.51 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  30.11 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  39.51 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  38.67 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  41.03 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  39.24 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  39.24 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  35.63 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  34.94 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  34.94 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  34.94 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  36.96 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  37.04 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  35.06 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  31.65 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  42.7 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  35.06 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  41.57 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  36.05 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  38.64 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  34.12 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  33.72 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  34.18 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  36.36 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  38.14 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  35.16 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  29.07 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  37.63 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  37.97 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  40.58 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  33.78 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  33.78 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  28.99 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  36.56 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  36.59 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  28.57 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  32.18 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  35.87 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  35.53 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  35.53 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  37.7 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  34.57 
 
 		 105 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  34.57 
 
 		 105 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  27.38 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  31.03 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  31.03 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  28.99 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  31.65 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  31.4 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.43 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  35.53 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  34.21 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  34.21 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  36.51 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  32.18 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>