67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1540 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  100 
 
 
95 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  91.58 
 
 
97 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  91.58 
 
 
97 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  91.58 
 
 
97 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  88.42 
 
 
95 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  88.42 
 
 
95 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  88.3 
 
 
97 aa  156  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  74.19 
 
 
96 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  70.97 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  74.19 
 
 
96 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  64.52 
 
 
100 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  73.12 
 
 
96 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  65.91 
 
 
93 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  66.32 
 
 
98 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  63.33 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  64.44 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  58.89 
 
 
96 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  63.33 
 
 
92 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  60 
 
 
89 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  48.94 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  45.74 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  48.28 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  42.35 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  35.71 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  32.14 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  32.22 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  32.65 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  34.69 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  36.17 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  33.67 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  35.8 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.26 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  31.52 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  31.91 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  36.36 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  37.93 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  35.79 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  32.65 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  33.75 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  29.9 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  36.25 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  34.69 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  36.25 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  36.25 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  31.63 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  36.25 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  32.99 
 
 
101 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  35.48 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  31.58 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  35.48 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  33.33 
 
 
94 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  27.55 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  39.53 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  30.61 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  38.54 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  32.56 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  31.58 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  31.63 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  34.41 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  41.51 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  33.72 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  29.59 
 
 
99 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  33.67 
 
 
99 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>