31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2283 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  100 
 
 		 89 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  58.89 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  60 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  60 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  58.89 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  55.56 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  57.78 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  55.56 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  54.44 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  54.44 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  56.67 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  48.89 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  57.78 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  53.33 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  48.89 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  48.86 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  45.05 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  51.72 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  47.25 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  40.91 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  35.96 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  30.77 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  36.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  40.28 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  35.23 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  32.95 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  32.94 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  30.23 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>