80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1952 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  193  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  74.49 
 
 		 98 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  68.37 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  65.62 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  65.62 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  65.62 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  66.32 
 
 		 95 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  66.67 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  65.59 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  69.15 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  64.52 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  60.87 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  69.47 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  58.59 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  70.33 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  56.67 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  57.78 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  56.67 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  56.82 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  54.55 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  53.33 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  46.59 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  46.51 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  36.96 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  33.67 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  33.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  34.02 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  35.35 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  30.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  30.61 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  32.5 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  31.63 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  36 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  29.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  36.36 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  30.95 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  32.65 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  31.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  27.55 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  35.37 
 
 		 94 aa  42  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  28.92 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  36.78 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  31.63 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  40.26 
 
 		 95 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  32.98 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  30.61 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  30.61 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  36.25 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  35.11 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  32.99 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  29.59 
 
 		 99 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  32.65 
 
 		 100 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.57 
 
 		 100 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>